Le marché des logiciels de facturation explose. Entre les solutions cloud américaines, les logiciels français, les outils gratuits et les usines à gaz, comment s’y retrouver ? Voici les 10 critères qui comptent vraiment.

1. Conformité légale française

Pourquoi c’est crucial : Une facture non conforme peut être rejetée par l’administration fiscale. À partir de septembre 2026, seule une certification délivrée par un organisme accrédité (NF525 ou LNE) sera acceptée pour les logiciels de caisse. L’auto-attestation par l’éditeur ne sera plus valable.

Ce qu’il faut vérifier :

  • Mentions obligatoires automatiques (SIRET, TVA, conditions de paiement, pénalités de retard)
  • Numérotation chronologique sans rupture
  • Attestation de conformité fournie par l’éditeur
  • Piste d’audit fiable (impossibilité de modifier une facture émise)

Attention : Les logiciels américains (QuickBooks, FreshBooks) ne sont pas toujours à jour des spécificités françaises.

2. Gestion de la TVA

Pourquoi c’est crucial : La TVA représente 20% de votre facturation. Une erreur coûte cher.

Ce qu’il faut vérifier :

  • Support des différents taux (20%, 10%, 5.5%, 2.1%)
  • Option TVA sur débits / encaissements
  • Calcul automatique de la TVA déductible
  • Export pour la déclaration (CA3, CA12)
  • Gestion de la TVA intracommunautaire

3. Automatisation

Pourquoi c’est crucial : Le temps passé sur l’administratif est du temps perdu pour votre cœur de métier.

Ce qu’il faut vérifier :

  • Import automatique des factures fournisseurs (email, scan)
  • Extraction des données par IA
  • Relances automatiques des impayés
  • Réconciliation bancaire automatique
  • Génération automatique des échéances récurrentes

Le test décisif : Combien de clics pour créer une facture client complète ? Moins de 5, c’est bien. Plus de 10, fuyez.

4. Sécurité des données

Pourquoi c’est crucial : Vos données comptables sont confidentielles. Elles révèlent tout de votre entreprise.

Ce qu’il faut vérifier :

  • Où sont stockées les données ? (France, UE, US ?)
  • Quel niveau de chiffrement ?
  • Qui a accès à vos données ?
  • Conformité RGPD
  • Possibilité d’export complet de vos données

Notre avis : Privilégiez le stockage local ou un hébergement européen. Évitez les solutions soumises au Cloud Act américain.

5. Intégrations

Pourquoi c’est crucial : Votre logiciel de facturation doit communiquer avec vos autres outils.

Ce qu’il faut vérifier :

  • Connexion bancaire (pour la réconciliation)
  • Connexion email (Gmail, Outlook)
  • Export comptable (FEC, formats standards)
  • Possibilité de connecter d’autres outils (si vous avez des besoins spécifiques)

6. Multi-entreprises

Pourquoi c’est crucial : Si vous gérez plusieurs structures (holding + filiale, SCI + activité principale), vous voulez tout centraliser.

Ce qu’il faut vérifier :

  • Nombre d’entreprises incluses dans l’offre
  • Cloisonnement des données entre entreprises
  • Possibilité de basculer facilement d’une entité à l’autre

7. Ergonomie

Pourquoi c’est crucial : Un logiciel compliqué ne sera pas utilisé. Vous retournerez à Excel.

Ce qu’il faut vérifier :

  • Interface claire et moderne
  • Temps de prise en main (idéalement < 1 heure)
  • Application mobile (si besoin de mobilité)
  • Raccourcis clavier pour les tâches fréquentes

8. Support client

Pourquoi c’est crucial : Quand vous avez un problème urgent (facture bloquée, bug), vous avez besoin d’aide rapidement.

Ce qu’il faut vérifier :

  • Support en français
  • Temps de réponse moyen
  • Canaux disponibles (email, téléphone, chat)
  • Horaires du support
  • Base de connaissances / documentation

Attention : Les solutions gratuites ou low-cost ont souvent un support inexistant ou payant.

9. Pérennité de l’éditeur

Pourquoi c’est crucial : Vous allez confier des années de données comptables à cet éditeur. S’il ferme, que deviennent vos données ?

Ce qu’il faut vérifier :

  • Ancienneté de l’éditeur
  • Nombre de clients
  • Modèle économique viable (méfiez-vous du “tout gratuit”)
  • Possibilité d’exporter vos données dans un format standard

10. Prix

Pourquoi c’est crucial : Le logiciel doit être rentable. Si vous payez plus que ce qu’il vous fait économiser, c’est inutile.

Ce qu’il faut vérifier :

  • Tarif mensuel ou annuel
  • Ce qui est inclus (nombre de factures, utilisateurs, entreprises)
  • Coûts cachés (support, fonctionnalités premium, stockage)
  • Engagement (mensuel sans engagement = idéal)

Calcul rapide : Si le logiciel vous économise 5h/mois à 50€/h = 250€/mois de valeur. Un abonnement à 100€/mois est très rentable.

Tableau comparatif

CritèreAquilaPennylaneQuickBooksWave
Conformité FR✅✅⚠️❌
TVA complète✅✅✅⚠️
IA/Automatisation✅✅⚠️❌
Données locales✅❌❌❌
RGPD natif✅✅⚠️❌
Multi-entreprises✅ (2)✅✅❌
Support FR✅✅⚠️❌
Prix/mois110€50-200€25-100€Gratuit*

*Wave : gratuit mais monétise vos données, support payant, non conforme FR.

Notre recommandation

Pour une TPE française (< 50 factures/mois)

Priorités : Conformité légale, simplicité, prix raisonnable

Solution recommandée : Un logiciel français avec automatisation IA. Évitez les solutions américaines qui ne maîtrisent pas les spécificités françaises (TVA, mentions légales).

Pour une PME (50-500 factures/mois)

Priorités : Automatisation maximale, intégration comptable, multi-utilisateurs

Solution recommandée : Un logiciel avec IA (extraction automatique, réconciliation bancaire) pour absorber le volume. Le temps économisé justifie un abonnement plus élevé.

Pour les professions réglementées

Priorités : Sécurité, confidentialité, souveraineté des données

Solution recommandée : Un logiciel avec stockage local et chiffrement. Évitez absolument le cloud américain (Cloud Act).

Conclusion

Le “meilleur” logiciel de facturation n’existe pas. Le meilleur, c’est celui qui correspond à vos besoins :

  • Volume de factures
  • Besoin d’automatisation
  • Sensibilité des données
  • Budget

Prenez le temps de tester 2-3 solutions avant de vous engager. La plupart offrent une démo.

Et n’oubliez pas : le logiciel le plus cher n’est pas celui que vous payez, c’est celui qui vous fait perdre du temps.

Sources